Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID4AP29374 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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