Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms