Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms