Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPR89BP0CG08 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms