Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFMP07197 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFMP07197 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFMP07197 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFMP07197 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms