Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV3-15P01624 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-15P01624 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms