Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG13O75143 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG13O75143 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG13O75143 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms