Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms