Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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