Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms