Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAP23O00161 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms