Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms