Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VWA8A3KMH1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VWA8A3KMH1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms