Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms