Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms