Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF639Q9UID6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms