Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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