Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APEX2Q9UBZ4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms