Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms