Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms