Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP7BPQ9NSQ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms