Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms