Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTMR12Q9C0I1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms