Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUP58Q9BVL2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms