Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms