Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CICQ96RK0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CICQ96RK0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms