Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB3IPQ96QF0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB3IPQ96QF0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms