Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM20AQ96MK3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM20AQ96MK3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM20AQ96MK3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM20AQ96MK3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms