Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms