Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms