Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUB1Q96FW1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms