Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms