Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPTSSBQ8NFR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms