Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms