Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms