Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CATSPER4Q7RTX7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CATSPER4Q7RTX7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms