Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms