Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD40Q6AI12 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms