Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms