Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00303Q3SY05 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms