Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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