Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CTF1Q16619 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms