Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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GABRA6Q16445 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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GABRA6Q16445 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GABRA6Q16445 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA6Q16445 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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