Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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