Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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ALX1Q15699 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ALX1Q15699 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ALX1Q15699 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ALX1Q15699 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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