Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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