Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms