Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EEA1Q15075 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms