Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ODF1Q14990 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms