Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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COL9A2Q14055 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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